Com base numa metodologia onde se destacam a utilização pioneira em Portugal do conceito de teoria da programação e a mobilização de um vasto conjunto de métodos e processos de recolha de informação (entrevistas a stakeholders do QREN, painéis de discussão, estudos de caso, inquéritos a promotores de operações, análise documental e tratamento de informação fornecida pelo Observatório do QREN), o estudo responde a um conjunto de questões transversais de avaliação e a um vasto conjunto de questões específicas por prioridade operacional temática. Com base na aplicação da teoria da programação, a avaliação identifica factores críticos e relaciona-os com as questões do modelo de governação. O trabalho definiu, no seio da vasta panóplia de questões de avaliação, um conjunto de dimensões estratégicas que se revelaram cruciais para elaborar as conclusões relativamente: à Agenda da Competitividade (Contributo do QREN para a alteração do perfil de especialização da economia portuguesa; e contributo do QREN para o alargamento da base territorial da competitividade da economia portuguesa); à Agenda do Potencial Humano (Contributo do QREN para uma modernização inclusiva baseada numa população qualificada, envolvendo vários aspectos da intervenção pública que incluem a dinamização da oferta formativa, a qualidade da mesma, bem como a evolução da procura de qualificações que são geradas por essa oferta); à Agenda da Valorização do Território (Articulação entre objectivos, instrumentos e entidades responsáveis pela implementação do QREN em termos territoriais; e Grau de integração e transversalidade da Política de Cidades). Um significativo conjunto de recomendações (estratégicas, operacionais, condições de políticas públicas e implicações em termo de reprogramação) fecha o relatório que se inicia com um sumário executivo.